- закапывание носовых ходов: профилактика и лечение ОРВИ и гриппа, аденоиды, риниты и др. ЛОР-заболевания 
- закапывание в уши: отиты, в т.ч. гнойные
- полоскание горла и обработка миндалин: ангины, ларингофарингиты и т.п.. 
- полоскание ротовой полости: стоматиты, гингивиты, парадонтиты и др. воспалительные заболевания десен и слизистой ротовой полости
- аппликации и/или маски на кожу: герпес, экземы, атопический дерматит, аллергодерматозы, раны, ожоги и др. поражения кожи
- вагинально: вагинозы, вагиниты и др. урогенитальные инфекции различной этиологии, синехии 
- ректально (микроклизмы): воспалительные заболевания кишечника, мочевого пузыря, почек аллергодерматозы

Прием внутрь: 
Бифидум БАГ и Трилакт – это жидкие формы готовые к употреблению; рекомендуется встряхнуть флакон перед употреблением 
Бифидум БАГ и Трилакт принимаются за 15-20 мин. до еды, или через час после приёма пищи. Детям раннего возраста пробиотик дается непосредственно перед кормлением или с едой. Перед проглатыванием препарата рекомендуется прополоскать им полость рта и горла. 
Жидкий пробиотик можно также вводить в бутылочку со смесью (для детей на искусственном вскармливании), или наносить на сосок и ареолу молочной железы матери перед кормлением ребенка (при грудном вскармливании)
Экофлор принимается за 30-40мин до еды с небольшим количеством воды или в киселе (для детей раннего возраста и при затруднениях с приемом порошков).
Дозировать жидкие препараты можно с помощью шприца (не вскрывая флакон) или пипеткой
Препараты можно пить ничем не запивая или запивать водой, молоком или кефиром 
Не смешивать с горячей водой

Прием местно:
Закапывание носовых ходов: Бифидум БАГ и/ или Трилакт – нативный или, при необходимости, в разведении с физ. раствором или водой комнатной температуры в соотношении 1:3 -1:1 (обычно для детей раннего возраста). Детям до 3 лет: по 2-3 капли, детям старше 3-х лет по 3 - 6 капель в каждую ноздрю 2-3 раза в день после обычного туалета носовых ходов. Рекомендуется «глубокое» закапывание хотя бы один раз в сутки (в положении с сильно запрокинутой головой или в коленно-локтевой позе) 
Закапывание в уши – по 2-3 капли Бифидум БАГ и/или Трилакт 2-3 раза в день, после очистки слухового прохода
Полоскания рта и горла - если ребенок еще не умеет полоскать горло, можно задержать препарат в горле на несколько секунд и потом проглотить 
Обработка миндалин – смазывать Трилактом 2-4 раза в день по 1 мл 
Ректально ( микроклизмы ): 1 раз в сутки (желательно после дефекации); детям до 12 лет - 1 мл Бифидум БАГ в 5 мл воды или физраствора; детям старше 12 и взрослым 5 мл Бифидум БАГ в 30 мл воды или физраствора
Вагинально (девочкам только аппликации на прокладках или салфетках и ванночки!) – по 1-3 мл Бифидум БАГ и/или Трилакт 1 раз в сутки. Рекомендуемый курс 10-14 дней. При необходимости курс может быть продлен до 28 дней. 
На кожу (аппликации, маски): препарат нанести тонким слоем на проблемный участок кожи 2-3 раза в день или на ночь. Смывать водой без мыла.

Прием внутрь
Длительность курса: 40 дней для детей от 12 лет и взрослых

На курс для 1 человека:
Бифидум БАГ 20 флаконов
Трилакт 10 флаконов
Экофлор 10-20 пакетов

Бифидум БАГ и/ или Трилакт для закапывания в нос в разведении с физ. раствором или водой комнатной температуры в соотношении 1:4 -1:5. 

Длительность курса: 40 дней, для детей от 12 лет и взрослых

Микрофлора беременных женщин нуждается в особой поддержке, так как во время беременности наряду со снижением иммунитета возникают и прогрессируют дисбиотические процессы в кишечнике, влагалище, на коже, что может приводить к манифестации воспалительных процессов. Максимальный «провал» со стороны микрофлоры чаще всего возникает на восьмом месяце.

Во время беременности необходимо провести несколько курсов пробиотикотерапии:
Первый курс проводится на ранних сроках - на 3-й – 8-й неделях.
Схема приема препаратов профилактическая (перорально-внутрь)
Длительность курса: 30 дней

Для укрепления иммунной системы всего организма показано провести одновременную  коррекцию микрофлоры кишечника и влагалища  пробиотическими препаратами Бифидум БАГ и Трилакт. Прием жидких пробиотиков внутрь по классической схеме и интравагинальные инсталляции (тампоны с Бифидум БАГ на ночь курсом 10-12 дней ). 3 мл Бифидум БАГ+5мл кипяченой воды комнатной температуры , опустить в этот раствор тампон и ввести на ночь на 8-10 часов.

2. Второй курс проводится в 20 недель беременности.
Схема приема  препаратов профилактическая (перорально-внутрь)
Длительность курса: 30 дней

3. Третий курс рекомендуется проводить за месяц до родов. Это поможет нормализовать микрофлору во влагалище, подготовить родовые пути: профилактика восходящего инфицирования в родах, в период предродовой подготовки.
Схема приема  препаратов профилактическая (перорально-внутрь)
Длительность курса: 30 дней

с 1 по 10 день - Экофлор по 1 пакету 2 раза в день (утром, или 1 пакет утром и 1 пакет днем), Бифидум БАГ по 5-10 мл в сутки (можно однократно на ночь);
с 11 по 40 день - Бифидум БАГ по 3-5 мл в день (на ночь).
Трилакт в данной ситуации применять не рекомендуется, так как он содержит высокую концентрацию кислот и стимулирует желудочную секрецию.

При гастродуоденитах с пониженной кислотообразующей функцией:
Длительность курса 40 дней для взрослых

с 1 по 10 день - Экофлор по 1 пакету 2 раза в день (утром, или 1 пакет утром и 1 пакет днем), Бифидум по 5 мл в день (вечером);
с 11 по 40 день – Трилакт по 6 мл, Бифидум БАГ по 6 мл (на ночь).

Показания для местного применения Бифидум БАГ:
- вагинально: молочница (кондидозы), воспалительные заболевания (вагиниты);
- на кожу: опрелости, атопические дерматиты, аллергии, гнойничковые кожные высыпания, герпес 1 типа, экземы, ожоги, раны, угревая сыпь.